Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms