Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC42EP1Q00587 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms