Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CXCL6P80162 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms