Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms