Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms