Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK1P57059 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK1P57059 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK1P57059 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK1P57059 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK1P57059 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK1P57059 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK1P57059 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK1P57059 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK1P57059 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK1P57059 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK1P57059 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK1P57059 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK1P57059 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK1P57059 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK1P57059 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK1P57059 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK1P57059 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK1P57059 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK1P57059 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK1P57059 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK1P57059 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK1P57059 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK1P57059 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK1P57059 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK1P57059 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK1P57059 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK1P57059 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK1P57059 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK1P57059 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK1P57059 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK1P57059 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK1P57059 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK1P57059 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK1P57059 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK1P57059 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK1P57059 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK1P57059 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK1P57059 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK1P57059 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms