Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms