Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TPTEP56180 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TPTEP56180 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPTEP56180 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPTEP56180 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPTEP56180 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPTEP56180 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPTEP56180 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPTEP56180 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TPTEP56180 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPTEP56180 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPTEP56180 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPTEP56180 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPTEP56180 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TPTEP56180 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms