Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMSP52788 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMSP52788 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMSP52788 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMSP52788 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMSP52788 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMSP52788 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMSP52788 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMSP52788 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMSP52788 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMSP52788 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMSP52788 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMSP52788 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMSP52788 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMSP52788 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMSP52788 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMSP52788 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMSP52788 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMSP52788 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMSP52788 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMSP52788 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMSP52788 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMSP52788 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMSP52788 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMSP52788 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms