Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms