Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPIAP49247 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPIAP49247 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPIAP49247 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RPIAP49247 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPIAP49247 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPIAP49247 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPIAP49247 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
RPIAP49247 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPIAP49247 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPIAP49247 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPIAP49247 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPIAP49247 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPIAP49247 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPIAP49247 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPIAP49247 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPIAP49247 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPIAP49247 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RPIAP49247 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPIAP49247 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPIAP49247 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPIAP49247 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPIAP49247 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPIAP49247 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPIAP49247 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPIAP49247 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPIAP49247 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPIAP49247 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms