Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A9P48067 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms