Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNT2P45379 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms