Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35P42766 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35P42766 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35P42766 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35P42766 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35P42766 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35P42766 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35P42766 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35P42766 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35P42766 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL35P42766 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL35P42766 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL35P42766 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL35P42766 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL35P42766 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms