Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPOP42166 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPOP42166 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPOP42166 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPOP42166 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPOP42166 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPOP42166 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPOP42166 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPOP42166 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPOP42166 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPOP42166 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPOP42166 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPOP42166 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPOP42166 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPOP42166 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPOP42166 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPOP42166 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPOP42166 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPOP42166 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPOP42166 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPOP42166 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPOP42166 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPOP42166 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMPOP42166 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMPOP42166 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMPOP42166 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMPOP42166 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMPOP42166 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPOP42166 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPOP42166 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPOP42166 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPOP42166 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPOP42166 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPOP42166 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPOP42166 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPOP42166 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPOP42166 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPOP42166 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPOP42166 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPOP42166 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPOP42166 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPOP42166 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPOP42166 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPOP42166 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPOP42166 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPOP42166 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPOP42166 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPOP42166 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPOP42166 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPOP42166 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPOP42166 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPOP42166 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPOP42166 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPOP42166 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPOP42166 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPOP42166 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPOP42166 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms