Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MLH1P40692 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MLH1P40692 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MLH1P40692 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MLH1P40692 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MLH1P40692 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MLH1P40692 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MLH1P40692 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MLH1P40692 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MLH1P40692 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MLH1P40692 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MLH1P40692 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MLH1P40692 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MLH1P40692 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MLH1P40692 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MLH1P40692 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MLH1P40692 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MLH1P40692 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MLH1P40692 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MLH1P40692 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms