Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms