Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms