Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT2P35908 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT2P35908 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT2P35908 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT2P35908 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT2P35908 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT2P35908 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT2P35908 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT2P35908 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT2P35908 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT2P35908 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT2P35908 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT2P35908 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT2P35908 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT2P35908 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT2P35908 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT2P35908 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT2P35908 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT2P35908 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT2P35908 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT2P35908 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT2P35908 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT2P35908 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT2P35908 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT2P35908 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT2P35908 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT2P35908 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT2P35908 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT2P35908 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT2P35908 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT2P35908 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT2P35908 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT2P35908 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT2P35908 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT2P35908 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT2P35908 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT2P35908 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT2P35908 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT2P35908 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT2P35908 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT2P35908 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT2P35908 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT2P35908 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms