Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms