Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC27P30260 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC27P30260 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC27P30260 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC27P30260 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC27P30260 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC27P30260 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC27P30260 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC27P30260 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC27P30260 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC27P30260 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC27P30260 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC27P30260 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC27P30260 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC27P30260 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC27P30260 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC27P30260 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC27P30260 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC27P30260 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC27P30260 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC27P30260 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC27P30260 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC27P30260 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC27P30260 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC27P30260 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC27P30260 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC27P30260 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC27P30260 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC27P30260 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC27P30260 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC27P30260 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms