Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms