Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP1P29466 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP1P29466 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP1P29466 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP1P29466 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP1P29466 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP1P29466 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP1P29466 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP1P29466 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP1P29466 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP1P29466 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP1P29466 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP1P29466 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASP1P29466 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASP1P29466 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASP1P29466 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASP1P29466 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASP1P29466 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP1P29466 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms