Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD34P28906 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD34P28906 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms