Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms