Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms