Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms