Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMLP26374 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMLP26374 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMLP26374 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMLP26374 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMLP26374 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMLP26374 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMLP26374 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMLP26374 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMLP26374 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMLP26374 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMLP26374 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMLP26374 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMLP26374 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMLP26374 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMLP26374 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMLP26374 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMLP26374 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMLP26374 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMLP26374 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMLP26374 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMLP26374 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMLP26374 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMLP26374 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMLP26374 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMLP26374 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMLP26374 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMLP26374 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMLP26374 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMLP26374 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMLP26374 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms