Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE1P24864 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE1P24864 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE1P24864 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE1P24864 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE1P24864 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE1P24864 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCNE1P24864 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE1P24864 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE1P24864 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE1P24864 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE1P24864 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE1P24864 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE1P24864 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE1P24864 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCNE1P24864 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE1P24864 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE1P24864 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE1P24864 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE1P24864 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNE1P24864 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms