Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms