Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms