Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms