Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR1P18146 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR1P18146 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR1P18146 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR1P18146 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR1P18146 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR1P18146 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR1P18146 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR1P18146 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR1P18146 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR1P18146 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR1P18146 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms