Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DESP17661 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DESP17661 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DESP17661 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DESP17661 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DESP17661 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DESP17661 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DESP17661 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DESP17661 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DESP17661 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DESP17661 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DESP17661 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DESP17661 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DESP17661 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DESP17661 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DESP17661 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DESP17661 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DESP17661 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DESP17661 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DESP17661 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DESP17661 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DESP17661 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms