Protein–RNA interactions for Protein: P15514

AREG, Amphiregulin, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AREGP15514 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AREGP15514 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AREGP15514 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AREGP15514 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AREGP15514 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AREGP15514 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AREGP15514 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AREGP15514 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AREGP15514 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AREGP15514 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AREGP15514 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AREGP15514 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AREGP15514 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AREGP15514 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AREGP15514 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AREGP15514 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AREGP15514 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AREGP15514 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AREGP15514 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AREGP15514 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AREGP15514 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AREGP15514 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms