Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2F2P13984 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms