Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRG2P13727 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRG2P13727 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRG2P13727 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRG2P13727 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRG2P13727 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRG2P13727 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRG2P13727 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRG2P13727 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRG2P13727 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms