Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP3P12645 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP3P12645 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP3P12645 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP3P12645 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP3P12645 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP3P12645 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP3P12645 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP3P12645 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP3P12645 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP3P12645 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms