Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGAMP11215 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms