Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI3P10071 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI3P10071 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI3P10071 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI3P10071 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI3P10071 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLI3P10071 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLI3P10071 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLI3P10071 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLI3P10071 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLI3P10071 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLI3P10071 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLI3P10071 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLI3P10071 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLI3P10071 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLI3P10071 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLI3P10071 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI3P10071 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GLI3P10071 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GLI3P10071 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GLI3P10071 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GLI3P10071 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GLI3P10071 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GLI3P10071 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GLI3P10071 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GLI3P10071 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GLI3P10071 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GLI3P10071 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GLI3P10071 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GLI3P10071 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GLI3P10071 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLI3P10071 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GLI3P10071 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLI3P10071 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLI3P10071 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLI3P10071 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLI3P10071 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLI3P10071 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLI3P10071 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLI3P10071 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLI3P10071 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI3P10071 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI3P10071 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI3P10071 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI3P10071 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI3P10071 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI3P10071 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI3P10071 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI3P10071 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI3P10071 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI3P10071 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI3P10071 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI3P10071 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI3P10071 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI3P10071 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms