Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VIL1P09327 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIL1P09327 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VIL1P09327 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIL1P09327 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIL1P09327 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIL1P09327 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIL1P09327 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIL1P09327 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIL1P09327 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIL1P09327 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIL1P09327 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIL1P09327 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VIL1P09327 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIL1P09327 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIL1P09327 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIL1P09327 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIL1P09327 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIL1P09327 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIL1P09327 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIL1P09327 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIL1P09327 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIL1P09327 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIL1P09327 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIL1P09327 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIL1P09327 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIL1P09327 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIL1P09327 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIL1P09327 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIL1P09327 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIL1P09327 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIL1P09327 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIL1P09327 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIL1P09327 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIL1P09327 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIL1P09327 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIL1P09327 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIL1P09327 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIL1P09327 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIL1P09327 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIL1P09327 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIL1P09327 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIL1P09327 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIL1P09327 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIL1P09327 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIL1P09327 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIL1P09327 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIL1P09327 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIL1P09327 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIL1P09327 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIL1P09327 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIL1P09327 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms