Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN3P07498 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN3P07498 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN3P07498 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSN3P07498 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSN3P07498 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSN3P07498 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSN3P07498 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSN3P07498 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSN3P07498 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms