Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLK3P07288 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLK3P07288 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLK3P07288 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLK3P07288 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLK3P07288 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLK3P07288 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLK3P07288 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLK3P07288 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLK3P07288 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLK3P07288 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLK3P07288 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms