Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBE1P02100 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBE1P02100 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms