Protein–RNA interactions for Protein: P01571

IFNA17, Interferon alpha-17, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA17P01571 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA17P01571 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms