Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSD2O96028 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSD2O96028 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSD2O96028 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSD2O96028 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSD2O96028 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSD2O96028 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSD2O96028 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSD2O96028 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSD2O96028 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
NSD2O96028 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSD2O96028 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSD2O96028 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSD2O96028 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSD2O96028 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSD2O96028 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSD2O96028 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSD2O96028 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSD2O96028 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSD2O96028 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSD2O96028 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NSD2O96028 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSD2O96028 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSD2O96028 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSD2O96028 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSD2O96028 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSD2O96028 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSD2O96028 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSD2O96028 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSD2O96028 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSD2O96028 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NSD2O96028 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSD2O96028 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSD2O96028 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NSD2O96028 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSD2O96028 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NSD2O96028 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSD2O96028 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSD2O96028 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSD2O96028 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSD2O96028 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSD2O96028 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSD2O96028 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSD2O96028 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSD2O96028 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NSD2O96028 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms