Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms