Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRATO95237 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRATO95237 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRATO95237 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRATO95237 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRATO95237 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms