Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms