Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEBLO76041 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEBLO76041 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEBLO76041 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms